主实验室与辅助实验室的主要区别体现在功能和用途上：

主实验室

主实验室是进行分析、研究等核心实验的主要场所。它通常配备有精密的仪器和设备，用于执行关键的实验步骤和数据采集。例如，在生物安全实验室中，主实验室往往是污染风险最高的区域，通常包含生物安全柜、动物隔离器等关键设备。此外，样品处理实验室、微生物培养室、观察室等也属于主实验室的范畴。

辅助实验室

辅助实验室则是为实现核心实验而设置的辅助性实验室。它们通常用于准备实验材料、储存样品、进行预处理或后处理等工作。辅助实验室的设备可能相对简单，但同样对实验的顺利进行至关重要。常见的辅助实验室包括天平室、高温室、样品室等。这些实验室为主实验室提供了必要的支持和保障，确保了整个实验过程的顺利进行。