1.试剂准备区：该区域主要用于贮存试剂的制备、试剂的分装和扩增反应混合液的准备，以及离心管、吸头等消耗品的贮存和准备。此区域的空气应流向标本制备区。

2.标本制备区：该区域主要用于核酸提取、贮存及其加入至扩增反应管。此区域的空气应流向扩增反应混合物配置和扩增区。

3.扩增反应混合物配置和扩增区：该区域主要用于核酸合成、扩增、检测。此区域的空气应流向扩增产物分析区。

4.扩增产物分析区：该区域主要用于扩增片段的进一步分析测定。此区域为相对污染最严重的区域，其空气不应流向其他区域。