PCR实验室的压差设置对于防止交叉污染至关重要。通常，PCR实验室分为四个区域：试剂配制区、样品处理区、核酸扩增区、产物分析区。这些区域应保持相对独立，不能互通，且需遵循严格的单向流程，即只能从试剂配制区到样品处理区，再到核酸扩增区，最后到产物分析区。

压差设置上，一般遵循以下原则：

· 试剂配制区：设为微正压区域，通常设定为正压，如+15Pa，以防止外部空气进入造成污染。

· 样品处理区：同样设为微正压区域，但压力略低于试剂配制区，如+10Pa或+5Pa，以防止含核酸的气溶胶从试剂配制区进入。

· 核酸扩增区与产物分析区：设为微负压区域，如-5Pa至-20Pa，以防止含核酸的气溶胶扩散出去污染试剂与样品。

缓冲间的压差设置也至关重要，以确保实验室内外空气的有效隔离。常见的缓冲间压差设置方式包括：

· 所有缓冲间相对于区域房间内外，自身保持正压或负压状态。

· 缓冲间与实验区保持一致的压力梯度。